Se han creado cuatro sub-unidades para SuJu . Cada uno de los miembros se encuentran distribuidos en diferentes grupos, a excepción de Kibum. Las sub-unidades son parte de la estrategia de SM Entertainment de no limitar las actividades de Super Junior, con el objetivo de mostrar al grupo adaptándose a diferentes géneros musicales.
Super Junior KRY es un trío formado por Kyuhyun, Ryeowook, y Yesung. Super Junior T con sesi integrantes Leeteuk (Líder), Heechul, Kang-in, Shindong, Sungmin y Eunhyuk. Super Junior M El grupo estaba formado originalmente por cinco miembros de Super Junior: Donghae, Siwon, Ryeowook, Kyuhyun y Hangeng y dos miembros más que no pertenecen a Super Junior: Henry Lau y Zhou Mi. Tras la partida de Hangeng el año 2010, Super Junior M paralizó sus actividades durante más de un año, reestructurándose el 2011 con la adición de dos miembros de Super Junior: Eunhyuk y Sungmin.