Comenzaron siendo 12 jóvenes bajo la marca de SM Entertainment y producidos por Lee Soo Man. Estos miembros eran Leeteuk (el líder), Heechul, Han Geng, Yesung, Shindong, Kang-in, Sungmin, Eunhyuk, Donghae, Siwon, Kibum y Ryeowook.Debutaron el seis de diciembre del 2005 un álbum llamado ‘SuperJunior05 (TWINS)' y cuenta con un total de 11 canciones; Este disco tuvo dos sencillos que lo promocionaron ‘Miracle' y ‘TWINS (Knock Out)'. Este disco tuvo una gran aceptación en Corea logrando, en el primer mes, un total de 28.536 copias vendidas. Para el 2006 llegó un decimotercer integrante, Kyuhyun, quién reforzó a este grupo que debido a la gran cantidad de talentos que tenía reunido empezó a tener algunas subdivisiones que lanzaban singles. Estos eran: Super Junior-K.R.Y (5 de noviembre del 2006), Super Junior-T (23 de febrero del 2007), Super Junior-M (debutó en China, el 8 de abril de 2008 en el 8th Annual Music Chart Awards y con el lanzamiento de su primer video musical, "U" en línea), y Super Junior-Happy (El 3 de mayo del 2008 hubo un debut no oficial, ya que no se había presentado oficialmente el sub-grupo, ya el 7 de junio del 2008 fue el oficial)